Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms