Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VRK1Q99986 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms