Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC7Q96M83 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms