Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAF2Q96CS3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms