Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPAP2Q8IXW5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms