Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG4DQ86TL0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms