Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP31Q70CQ4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
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