Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms