Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRNP1Q6NT89 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms