Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEP350Q5VT06 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CEP350Q5VT06 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms