Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C10orf55Q5SWW7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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C10orf55Q5SWW7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
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C10orf55Q5SWW7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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C10orf55Q5SWW7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C10orf55Q5SWW7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C10orf55Q5SWW7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C10orf55Q5SWW7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C10orf55Q5SWW7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C10orf55Q5SWW7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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C10orf55Q5SWW7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C10orf55Q5SWW7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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