Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6CQ53S08 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6CQ53S08 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms