Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTXN3Q4LDR2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms