Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIST3H3Q16695 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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