Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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