Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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