Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA6Q15825 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms