Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SS18Q15532 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SS18Q15532 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SS18Q15532 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SS18Q15532 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SS18Q15532 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SS18Q15532 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SS18Q15532 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SS18Q15532 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms