Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRKQ15262 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
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