Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A1Q14973 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A1Q14973 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A1Q14973 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A1Q14973 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A1Q14973 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A1Q14973 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A1Q14973 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A1Q14973 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A1Q14973 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms