Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EXOSC2Q13868 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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EXOSC2Q13868 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EXOSC2Q13868 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EXOSC2Q13868 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EXOSC2Q13868 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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