Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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