Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHAF1BQ13112 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CHAF1BQ13112 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHAF1BQ13112 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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