Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MRPL28Q13084 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MRPL28Q13084 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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