Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAF1Q13077 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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TRAF1Q13077 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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TRAF1Q13077 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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TRAF1Q13077 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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TRAF1Q13077 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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TRAF1Q13077 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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TRAF1Q13077 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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TRAF1Q13077 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAF1Q13077 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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