Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYP4F3Q08477 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms