Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms