Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms