Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALD1Q05682 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms