Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms