Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF135P52742 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms