Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GRIA4P48058 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIA4P48058 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms