Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACADSBP45954 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACADSBP45954 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms