Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CASP2P42575 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CASP2P42575 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP2P42575 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms