Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCGF2P35227 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms