Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
OTX2P32243 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
OTX2P32243 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OTX2P32243 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms