Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCKARP32238 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCKARP32238 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCKARP32238 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCKARP32238 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCKARP32238 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCKARP32238 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCKARP32238 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCKARP32238 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCKARP32238 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms