Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDC27P30260 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDC27P30260 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDC27P30260 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC27P30260 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC27P30260 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC27P30260 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC27P30260 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC27P30260 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC27P30260 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC27P30260 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC27P30260 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC27P30260 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC27P30260 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC27P30260 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC27P30260 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC27P30260 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDC27P30260 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms