Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ECHS1P30084 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms