Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF2E2P29084 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms