Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HOXD10P28358 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD10P28358 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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