Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms