Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRKCHP24723 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRKCHP24723 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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