Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF1P22415 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF1P22415 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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