Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRIM21P19474 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM21P19474 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms