Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSPAN8P19075 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSPAN8P19075 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms