Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF3P18847 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF3P18847 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF3P18847 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF3P18847 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF3P18847 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF3P18847 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF3P18847 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF3P18847 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF3P18847 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF3P18847 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF3P18847 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF3P18847 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF3P18847 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF3P18847 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF3P18847 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF3P18847 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF3P18847 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF3P18847 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF3P18847 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF3P18847 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF3P18847 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF3P18847 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF3P18847 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF3P18847 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF3P18847 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms