Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD46P15529 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CD46P15529 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CD46P15529 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CD46P15529 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms