Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HKR1P10072 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HKR1P10072 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HKR1P10072 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HKR1P10072 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HKR1P10072 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HKR1P10072 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HKR1P10072 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HKR1P10072 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HKR1P10072 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HKR1P10072 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HKR1P10072 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HKR1P10072 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HKR1P10072 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HKR1P10072 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HKR1P10072 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HKR1P10072 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HKR1P10072 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HKR1P10072 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HKR1P10072 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HKR1P10072 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HKR1P10072 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HKR1P10072 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HKR1P10072 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HKR1P10072 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HKR1P10072 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HKR1P10072 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HKR1P10072 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HKR1P10072 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms