Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CENPBP07199 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CENPBP07199 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPBP07199 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPBP07199 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPBP07199 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPBP07199 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPBP07199 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPBP07199 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPBP07199 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPBP07199 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPBP07199 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPBP07199 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPBP07199 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPBP07199 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPBP07199 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CENPBP07199 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CENPBP07199 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CENPBP07199 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CENPBP07199 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CENPBP07199 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPBP07199 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPBP07199 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms